Here is a list of all documented class members with links to the class documentation for each member:

- p -

• p2 : MGT::ParamScanApp::ParamGridGen
• parseArrayBlast() : MGT::Proj::CrisprApp::CrisprApp
• parseCmdLine() : MGT::App::App
• parseCmdLinePost() : MGT::App::App , MGT::ParamScanTestApp::ParamScanTestApp , MGT::PhageHostApp::PhageHostApp , MGT::ImmApp::ImmApp , MGT::Proj::CrisprApp::CrisprApp , MGT::Proj::GbFeatApp::GbFeatApp , MGT::ImmClassifierApp::ImmClassifierApp , MGT::Proj::HctApp::HctApp , MGT::Proj::PhHostGosApp::PhHostGosApp , MGT::ImmScalingApp::ImmScalingApp , MGT::Proj::SynecApp::SynecApp
• performance() : MGT::PhageHostApp::PhageHostApp
• pickRandomSampleCounts() : MGT::TreeSamplerApp::TreeSamplerApp
• pickSeqOnTree() : MGT::ImmClassifierApp::ImmClassifierApp
• pilerCr() : MGT::Proj::CrisprApp::CrisprApp
• pilerCrOne() : MGT::Proj::CrisprApp::CrisprApp
• plotContigAnnotGff() : MGT::PhageHostApp::PhageHostApp
• plotCrispr() : MGT::Proj::CrisprMooreApp::CrisprMooreApp
• plotCrisprOneBioGd() : MGT::Proj::CrisprMooreApp::CrisprMooreApp
• plotCrisprOneBioGff() : MGT::Proj::CrisprMooreApp::CrisprMooreApp
• plotCrisprOneGff() : MGT::Proj::CrisprMooreApp::CrisprMooreApp
• predict() : MGT::ImmClassifierApp::ImmClassifierApp , MGT::PhageHostApp::PhageHostApp
• predictByScore() : MGT::Proj::PhHostGosApp::PhHostGosApp
• print() : MGT::KmerState , MGT::KmerStates , MGT::Kmer
• printGroupSeqHosts() : MGT::PhageHostDb::PhageHostSeqPicker
• process() : MGT::KmerCounterLadder
• processImmScores() : MGT::Proj::PhHostGosApp::PhHostGosApp , MGT::PhageHostApp::PhageHostApp
• processPhymmScores() : MGT::PhageHostApp::PhageHostApp
• pullGenBankProts() : MGT::Proj::HctApp::HctApp
• pullGenBankProtsCatOld() : MGT::Proj::HctApp::HctApp
• pullOutGroupProts() : MGT::Proj::HctApp::HctApp
• pullSeq() : MGT::Proj::HctApp::HctApp