- b -

• batchDepModes : MGT::App::App , MGT::Proj::SynecApp::SynecApp , MGT::Proj::PhHostGosApp::PhHostGosApp , MGT::Proj::CrisprApp::CrisprApp , MGT::PhageHostApp::PhageHostApp , MGT::ParamScanTestApp::ParamScanTestApp , MGT::ParamScanApp::ParamScanApp , MGT::ImmScalingApp::ImmScalingApp , MGT::ImmClassifierApp::ImmClassifierApp , MGT::ImmApp::ImmApp , MGT::CrossValidatorApp::CrossValidatorApp

- c -

• count : MGT::KmerStateData

- d -

• defField : MGT::Sql::DbSql , MGT::Sql::DbSqlLite
• dropList : MGT::Db::DbSeqSource

- e -

• EU_ROW : MGT::Kmers::NORM_POLICY
• EXPECT : MGT::Kmers::NORM_POLICY

- f -

• FREQ : MGT::Kmers::NORM_POLICY

- i -

• idLabRecs : MGT::TreeSamplerApp::TreeSamplerApp
• iFirstStateNonDegen : MGT::KmerStates

- l -

• labToName : MGT::TreeSamplerApp::TreeSamplerApp

- m -

• m_abcExt : MGT::AbcConvCharToInt
• m_CNucToINuc : MGT::AbcConvCharToInt
• m_counters : MGT::KmerCounterLadder
• m_data : MGT::KmerCounter
• m_dataDegen : MGT::KmerCounter
• m_firstIdState : MGT::KmerStates
• m_id : MGT::KmerStateData , MGT::KmerState
• m_iDataEnd : MGT::KmerCounter
• m_iDataExtr : MGT::KmerCounter
• m_iNucRevCompl : MGT::AbcConvCharToInt
• m_isRevComp : MGT::KmerState
• m_nAbc : MGT::AbcConvCharToInt
• m_nCodes : MGT::AbcConvCharToInt
• m_next : MGT::KmerState
• m_pData : MGT::KmerState
• m_pState : MGT::KmerStateData
• m_revComp : MGT::KmerState
• m_revCompPolicy : MGT::KmerCounterLadder , MGT::KmerCounter
• m_topBotDep : MGT::KmerCounterLadder
• m_topOneDep : MGT::KmerCounterLadder
• minLinnId : MGT::TaxaTree::TaxaLevels

- n -

• NONE_ROW : MGT::Kmers::NORM_POLICY

- p -

• p2 : MGT::ParamScanApp::ParamGridGen

- q -

• quote_method : MGT::GFF::GFF3Attributes

- r -

• rejectLabel : MGT::PredProcessor::PerfMetrics
• REVERSE : MGT::Kmers::NORM_POLICY

- s -

• sampNTrainSelf : MGT::TreeSamplerApp::TreeSamplerApp
• start : MGT::Util::Timer

- t -

• table : MGT::Db::DbSeqSource
• tblNames : MGT::TaxaIODb::NodeStorageDb
• tblNodes : MGT::CollectTaxa::TaxaCollector
• termTopRankLeaf : MGT::TreeSamplerApp::TreeSamplerApp
• termTopRankSeq : MGT::TreeSamplerApp::TreeSamplerApp